1941.10　陸軍病院として創設
1945.12　厚生省に移管、国立村山病院となる。
1947.04　結核療養所に転換、国立療養所村山病院と改称
1950.08　骨関節結核診療開始
1954.04　国立村山療養所となる。
1965.10　骨・運動器疾患及び脊髄損傷診療開始
1974.04　国立療養所村山病院へ改称
1977.04　骨・運動器疾患基幹施設となる。
1985.10　臨床研究部設置
1995.04　附属看護学校は、国立王子病院附属看護学校と統合し、昭和の森看護学校となる。
1999.03　国立病院・療養所の再編成計画の見直しで、「骨・運動器疾患の高度専門医療施設」及び「神経・筋疾患（脊髄損傷）の基幹医療施設」となる。
2001.07　高磁場（1.5Ｔ）ＭＲ及び低磁場（0.2Ｔ）ＭＲ装置を設置
2003.03　手術・機能訓練棟新設
2004.04　独立行政法人国立病院機構　村山医療センターと改称